06/J343

Correlación entre el perfil de metilación tumoral y las características clínico-patológicas del cáncer de mama.
Correlation between tumor metylation profile and clinico pathologica characteristics of breast cancer.

Director: VARGAS ROIG, Laura María
Correo Electrónico: vargasl@lab.cricyt.edu.ar

Co-Director: ROQUE MORENO, María

Integrantes: GAGO, Francisco Eduardo; MARZESE, Diego Matías; AQUISTAPACE, Fabricio.

Resumen Técnico: La hipótesis del presente proyecto es que el perfil de metilación tumoral de las 53 regiones genómicas que se estudiarán correlaciona con los factores histo-pronósticos utilizados en la actualidad en cáncer de mama. Para testearla, nos proponemos los siguientes objetivos: 1- Generar un banco de tumores primarios (tejido fresco), ganglios linfáticos regionales (tejido fresco) y ADN sérico de pacientes con cáncer de mama, 2- Caracterizar el perfil de metilación de 53 regiones de 36 genes relacionados con cáncer en los tumores de mama invasores, ganglios linfáticos axilares positivos y tejido mamario normal obtenido de los márgenes de seguridad quirúrgicos, 3- Identificar cuál/cuáles regiones están específicamente asociadas a la progresión tumoral mamaria y 4- Establecer si existe correlación entre el perfil de metilación tumoral y las características clínico-patológicas ya conocidas para cáncer de mama. Ingresarán en el estudio 100 pacientes con cáncer de mama previa firma de un consentimiento informado. Las metodologías que aplicaremos serán: extracción de ADN de los diferentes tejidos, estudio de regiones metiladas por Methyl-Specific Multiplex Ligation Dependent Probe Amplification (MS-MLPA), análisis de los resultados mediante el software GeneMarker vi .7 y estudios de correlación mediante tests estadísticos. Con los resultados a obtener esperamos profundizar los conocimientos sobre el rol de cada gen o grupo de genes en la progresión tumoral mamaria. De hallar correlación entre la metilación de un gen o un grupo de genes con los distintos factores clínico-patológicos ya conocidos para cáncer de mama, esperamos establecer esta marca epigenómica como información pronóstica complementaria a los marcadores ya existentes.

Summary: Our hypothesis is that the tumor methylation profile of 53 selected gene regions is correlated with histo-prognostic factors used in breast cancer. The specific aims are: 1- To generate a tumor bank of primary tumors (fresh tissue), regional lymph nodes (fresh tissue) and serum DNA from breast cancer patients, 2- To characterize the methylation profile of 53 gene regions of 36 genes related to cancer ¡n invasive breast cancer, positive lymph nodes and non tumor mammary tissue from the resection borders of surgery, 3- To identify which regions are associated specifically to mammary tumor progression and 4- To establish whether there is a correlation between tumor methylation profile and the clinical-pathological characteristics of breast cancer. One hundred patients will be enrolled after to sign the informed consent. We will perform: DNA extraction of the dífferent tissues, Methyl-Specific Multiplex Ligation Dependent Probe Amplification (MS-MLPA), analysis of the results using the software Gene Marker vi .7 and correlation studies using statistical tests. We will expect to deepen the knowledge of the role of each gene or group of genes in the mammary tumor progression. It we found correlation between gene or genes methylation with the known clinical-pathological factors in breast cancer, we will be able to establish the epigenomic signature as a complementary prognostic information of the markers used ¡n the medical practice.